化工原料从广州南沙进口清关需要以下文件：

1.进口许可证或许可证明文件

2.商业发票或合同

3.装箱单

4.提单或运单

5.报关单

6.原产地证明文件

7.卫生证明文件

8.化工类产品安全数据表

9.进口货物申报单

10.关税缴纳证据

另外，还需要注意一些特殊的安全和环保要求，如化学品安全标签、进口化学品注册等相关文件。如果有特殊要求，也应准备相关文件进行申报。