六类危险品从莆田进口清关的操作流程一般包括以下几个步骤：

1. 准备资料：首先，进口商需要准备相关文档，例如进口许可证、危险品备案表、危险品安全技术说明书、装箱单、发票和合同等。

2. 联系报关公司：进口商需要联系报关代理公司，委托其办理进口清关手续。

3. 报关：报关公司会根据货物特性和相关规章制度的要求，在莆田进行进口申报。

4. 检验检疫：货物到达口岸后，需要经过检验检疫部门的检查和审批，以确保安全性和符合相关标准。

5. 缴纳税费及手续费：通关后，进口商需要根据实际情况缴纳相关税费（如关税和增值税等）和办理相关手续费用（如检验检疫费等）。

6. 收取货物：当所有手续完备后，进口商可以前往海关指定地点领取货物。

需要注意的是，进口六类危险品时需要注意安全问题，遵守相关的安全法律法规，确保货物正常通过海关。同时，进口商需要考虑清关成本，并提前了解相关税费和手续费用，以避免不必要的麻烦。